A série especial Inocentes Presos foi pensada pela equipe de reportagem devido à grande quantidade de casos de injustiças que chegam ao jornal. O material, que trouxe aprofundamento inédito sobre o tema, é fruto de mais de um ano de apurações.

Em 2019, os repórteres passaram a coletar episódios por indicação de ONGs, Defensoria Pública e advogados, além de pesquisar no noticiário. Cem casos foram analisados, um a um, por meio de documentos judiciais, incursões a campo e entrevistas com advogados, vítimas das injustiças ou parentes.

A reportagem passou, então, a sistematizar todas as informações encontradas, catalogando tipos de erros mais frequentes, estado onde o fato ocorreu, cor e profissão das vítimas de injustiças. Também foram verificados dados oficiais sobre os andamentos dos processos, o que permitiu que a reportagem mostrasse o fenômeno dos inquéritos a jato.

Casos simbólicos sobre tipos de falhas judiciais ou policiais foram escolhidos para a realização de minidocumentários e maior aprofundamento. Vários especialistas foram ouvidos e ajudaram na contextualização do material.